过滤过程:沉淀或澄清的清水通过配水箱和U型管进入虹吸立管，再由顶盖内的布水挡板均匀分配到滤料层。水自上而下通过滤料层过滤，由低阻力配水装置收集，储存在清水区(即出水箱)。当水位上升到出水管时，过滤后的水自行流向清水池。
　　反洗过程:运行初期过滤器比较干净。随着运行时间的推移，滤层表面的颗粒杂质逐渐增多，水头损失也随之变大，虹吸立管内的水位会沿着虹吸立管缓慢上升。当水头损失增加到一定程度时，虹吸立管内的水位会上升到虹吸辅助喷嘴并从辅助喷嘴迅速流下，虹吸管内的空气会被水流和吸水管的卷吸和喷射作用带走，这样虹吸管就会形成真空，虹吸立管内的大量水就会虹吸到管顶边缘。即反洗过程开始。清水区的水通过连接管、集水区和布水装置自下而上冲洗滤料层。当清水区水位下降到虹吸破坏装置时(约5分钟)，虹吸被破坏，冲洗过程结束，再次开始过滤。
　　自动滤水器由控制结构和执行机构组成，执行机构包括减速器、滤水器体和电动排污装置；控制机构由控制柜、减速电机、排水阀电机和差压组成。滤水器的清洗和排放工作是根据用户的清洗要求，通过控制柜的预制程序完成的，不影响正常的工艺供水，可实现压差控制自动清洗、间歇定时自动清洗和手动控制清洗。

　　全自动自清洗滤水器接入管道系统后，水从下进水口进入滤水器，过滤后的水从出水口流出。当水中的杂质通过网芯时，由于体积大于网芯孔，被截留在网芯上。当它们积累到一定量时，进水口和出水口之间就有一定的压力差。当过滤网入口压力表和出口压力表的水压差达到规定值时(由于过滤网的精度直径不同，压差一般为0.15Mpa)，压差变送器信号接入控制信号，控制机构打开电动排水阀，电动减速机以每分钟3-6转的速度运行。水流会反向冲洗掉附着在滤网内侧壁上的杂质和污垢，然后通过排水管和排水阀将附着物从滤网中排出，从而在内部压差恢复正常时关闭排水阀。